Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox3aQ4TU90 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rhox3aQ4TU90 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rhox3aQ4TU90 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms