Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M2

Lrrc36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc36Q3V0M2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc36Q3V0M2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc36Q3V0M2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc36Q3V0M2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms