Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Lrrc43Q3V0L5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lrrc43Q3V0L5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lrrc43Q3V0L5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
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