Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc9Q3V038 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9Q3V038 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms