Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm12888Q3UW77 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm12888Q3UW77 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms