Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUX7

Uncharacterized protein C4orf46 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UUX7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q3UUX7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q3UUX7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UUX7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q3UUX7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms