Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms