Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULL6

Upf3b, UPF3 regulator of nonsense transcripts homolog B (yeast), mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf3bQ3ULL6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Upf3bQ3ULL6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Upf3bQ3ULL6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Upf3bQ3ULL6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms