Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc61Q3UJV1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc61Q3UJV1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc61Q3UJV1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms