Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Yipf3Q3UDR8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Yipf3Q3UDR8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms