Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q3U6N9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q3U6N9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q3U6N9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Q3U6N9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q3U6N9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q3U6N9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Q3U6N9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q3U6N9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q3U6N9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Q3U6N9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q3U6N9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Q3U6N9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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