Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pag1Q3U1F9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pag1Q3U1F9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms