Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KhsrpQ3U0V1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KhsrpQ3U0V1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KhsrpQ3U0V1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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