Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pnpla6Q3TRM4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pnpla6Q3TRM4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pnpla6Q3TRM4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms