Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cul4aQ3TCH7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cul4aQ3TCH7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cul4aQ3TCH7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms