Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam178bQ24JP3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam178bQ24JP3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam178bQ24JP3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms