Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Arhgap9Q1HDU4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Arhgap9Q1HDU4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms