Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Traf3ip1Q149C2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Traf3ip1Q149C2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Traf3ip1Q149C2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms