Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Kcnma1Q08460 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnma1Q08460 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnma1Q08460 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms