Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
AmbpQ07456 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
AmbpQ07456 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
AmbpQ07456 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms