Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cntn3Q07409 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cntn3Q07409 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cntn3Q07409 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms