Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Dnal1Q05A62 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Dnal1Q05A62 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Dnal1Q05A62 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115 ms