Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sox9Q04887 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sox9Q04887 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sox9Q04887 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms