Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Runx1Q03347 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Runx1Q03347 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Runx1Q03347 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms