Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gjb5Q02739 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb5Q02739 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb5Q02739 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms