Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Nme2Q01768 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nme2Q01768 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Nme2Q01768 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms