Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HmgcrQ01237 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HmgcrQ01237 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HmgcrQ01237 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms