Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gjb2Q00977 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gjb2Q00977 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gjb2Q00977 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms