Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atp9bP98195 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atp9bP98195 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp9bP98195 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp9bP98195 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp9bP98195 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp9bP98195 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp9bP98195 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp9bP98195 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp9bP98195 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp9bP98195 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atp9bP98195 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms