Protein–RNA interactions for Protein: P97858

Slc35b1, Solute carrier family 35 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b1P97858 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc35b1P97858 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc35b1P97858 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms