Protein–RNA interactions for Protein: P81117

Nucb2, Nucleobindin-2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb2P81117 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nucb2P81117 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nucb2P81117 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nucb2P81117 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms