Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acta1P68134 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta1P68134 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta1P68134 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta1P68134 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Acta1P68134 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Acta1P68134 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms