Protein–RNA interactions for Protein: P63005

Pafah1b1, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b1P63005 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pafah1b1P63005 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pafah1b1P63005 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pafah1b1P63005 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pafah1b1P63005 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pafah1b1P63005 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pafah1b1P63005 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pafah1b1P63005 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pafah1b1P63005 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pafah1b1P63005 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pafah1b1P63005 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pafah1b1P63005 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pafah1b1P63005 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pafah1b1P63005 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pafah1b1P63005 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pafah1b1P63005 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pafah1b1P63005 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pafah1b1P63005 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms