Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd2P62317 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Snrpd2P62317 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms