Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Siah1aP61092 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Siah1aP61092 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Siah1aP61092 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Siah1aP61092 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms