Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ActbP60710 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ActbP60710 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ActbP60710 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ActbP60710 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ActbP60710 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ActbP60710 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ActbP60710 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ActbP60710 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ActbP60710 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ActbP60710 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ActbP60710 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ActbP60710 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ActbP60710 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ActbP60710 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ActbP60710 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ActbP60710 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ActbP60710 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ActbP60710 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ActbP60710 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ActbP60710 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ActbP60710 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ActbP60710 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ActbP60710 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ActbP60710 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ActbP60710 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ActbP60710 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ActbP60710 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ActbP60710 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ActbP60710 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ActbP60710 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ActbP60710 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ActbP60710 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ActbP60710 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ActbP60710 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ActbP60710 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ActbP60710 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ActbP60710 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ActbP60710 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ActbP60710 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ActbP60710 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ActbP60710 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ActbP60710 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ActbP60710 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ActbP60710 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ActbP60710 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ActbP60710 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ActbP60710 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ActbP60710 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ActbP60710 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ActbP60710 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ActbP60710 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ActbP60710 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ActbP60710 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ActbP60710 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ActbP60710 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ActbP60710 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ActbP60710 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ActbP60710 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ActbP60710 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ActbP60710 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ActbP60710 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ActbP60710 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ActbP60710 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ActbP60710 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ActbP60710 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ActbP60710 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ActbP60710 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ActbP60710 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ActbP60710 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ActbP60710 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ActbP60710 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ActbP60710 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ActbP60710 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ActbP60710 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ActbP60710 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ActbP60710 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ActbP60710 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ActbP60710 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ActbP60710 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ActbP60710 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ActbP60710 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ActbP60710 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ActbP60710 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ActbP60710 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ActbP60710 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ActbP60710 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ActbP60710 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ActbP60710 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ActbP60710 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ActbP60710 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ActbP60710 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ActbP60710 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ActbP60710 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ActbP60710 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ActbP60710 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ActbP60710 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ActbP60710 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ActbP60710 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ActbP60710 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms