Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uchl4P58321 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Uchl4P58321 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Uchl4P58321 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms