Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snrpa1P57784 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Snrpa1P57784 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snrpa1P57784 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms