Protein–RNA interactions for Protein: P57016

Lad1, Ladinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lad1P57016 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lad1P57016 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lad1P57016 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lad1P57016 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lad1P57016 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lad1P57016 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms