Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gsc2P56916 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gsc2P56916 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gsc2P56916 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.1 ms