Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Cldn18P56857 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Cldn18P56857 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Cldn18P56857 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Cldn18P56857 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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Cldn18P56857 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Cldn18P56857 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Cldn18P56857 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn18P56857 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Cldn18P56857 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Cldn18P56857 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Cldn18P56857 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Cldn18P56857 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn18P56857 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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