Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtskP55097 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtskP55097 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtskP55097 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtskP55097 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtskP55097 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtskP55097 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtskP55097 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CtskP55097 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtskP55097 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtskP55097 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtskP55097 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtskP55097 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtskP55097 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtskP55097 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtskP55097 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtskP55097 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtskP55097 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtskP55097 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtskP55097 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtskP55097 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtskP55097 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtskP55097 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CtskP55097 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtskP55097 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtskP55097 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtskP55097 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtskP55097 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtskP55097 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtskP55097 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtskP55097 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtskP55097 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtskP55097 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtskP55097 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtskP55097 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtskP55097 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtskP55097 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtskP55097 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtskP55097 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtskP55097 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtskP55097 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtskP55097 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtskP55097 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtskP55097 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtskP55097 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtskP55097 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtskP55097 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtskP55097 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtskP55097 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtskP55097 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CtskP55097 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtskP55097 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtskP55097 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtskP55097 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtskP55097 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtskP55097 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtskP55097 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtskP55097 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CtskP55097 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtskP55097 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtskP55097 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtskP55097 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtskP55097 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtskP55097 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtskP55097 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtskP55097 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CtskP55097 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtskP55097 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtskP55097 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtskP55097 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CtskP55097 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtskP55097 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtskP55097 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CtskP55097 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CtskP55097 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtskP55097 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtskP55097 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtskP55097 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtskP55097 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtskP55097 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtskP55097 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtskP55097 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CtskP55097 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CtskP55097 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtskP55097 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtskP55097 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtskP55097 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtskP55097 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtskP55097 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CtskP55097 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtskP55097 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtskP55097 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtskP55097 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtskP55097 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtskP55097 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtskP55097 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtskP55097 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CtskP55097 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtskP55097 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CtskP55097 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms