Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Aqp4P55088 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Aqp4P55088 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms