Protein–RNA interactions for Protein: P54099

Polg, DNA polymerase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolgP54099 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PolgP54099 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PolgP54099 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PolgP54099 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PolgP54099 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PolgP54099 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PolgP54099 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PolgP54099 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PolgP54099 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolgP54099 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolgP54099 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PolgP54099 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolgP54099 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolgP54099 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolgP54099 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolgP54099 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolgP54099 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolgP54099 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolgP54099 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolgP54099 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolgP54099 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolgP54099 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolgP54099 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolgP54099 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolgP54099 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolgP54099 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolgP54099 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolgP54099 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolgP54099 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolgP54099 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolgP54099 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolgP54099 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolgP54099 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolgP54099 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolgP54099 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolgP54099 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolgP54099 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolgP54099 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolgP54099 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolgP54099 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolgP54099 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PolgP54099 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PolgP54099 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PolgP54099 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PolgP54099 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PolgP54099 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PolgP54099 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PolgP54099 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PolgP54099 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PolgP54099 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PolgP54099 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PolgP54099 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PolgP54099 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PolgP54099 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PolgP54099 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PolgP54099 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PolgP54099 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PolgP54099 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PolgP54099 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PolgP54099 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PolgP54099 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PolgP54099 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolgP54099 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolgP54099 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolgP54099 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PolgP54099 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolgP54099 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PolgP54099 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolgP54099 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolgP54099 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolgP54099 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolgP54099 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolgP54099 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PolgP54099 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolgP54099 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolgP54099 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PolgP54099 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolgP54099 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolgP54099 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolgP54099 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolgP54099 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolgP54099 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PolgP54099 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolgP54099 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PolgP54099 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolgP54099 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolgP54099 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PolgP54099 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolgP54099 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolgP54099 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PolgP54099 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PolgP54099 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PolgP54099 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PolgP54099 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PolgP54099 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolgP54099 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolgP54099 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PolgP54099 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolgP54099 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PolgP54099 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms