Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TspoP50637 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TspoP50637 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TspoP50637 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TspoP50637 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TspoP50637 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TspoP50637 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TspoP50637 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TspoP50637 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TspoP50637 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TspoP50637 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TspoP50637 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TspoP50637 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TspoP50637 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TspoP50637 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TspoP50637 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TspoP50637 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TspoP50637 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TspoP50637 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TspoP50637 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TspoP50637 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TspoP50637 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TspoP50637 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TspoP50637 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TspoP50637 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TspoP50637 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TspoP50637 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TspoP50637 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TspoP50637 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TspoP50637 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TspoP50637 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TspoP50637 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TspoP50637 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TspoP50637 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TspoP50637 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TspoP50637 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TspoP50637 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TspoP50637 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TspoP50637 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TspoP50637 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TspoP50637 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TspoP50637 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TspoP50637 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TspoP50637 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TspoP50637 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TspoP50637 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TspoP50637 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TspoP50637 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TspoP50637 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TspoP50637 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TspoP50637 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TspoP50637 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TspoP50637 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TspoP50637 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TspoP50637 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TspoP50637 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TspoP50637 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TspoP50637 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TspoP50637 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TspoP50637 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TspoP50637 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TspoP50637 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TspoP50637 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TspoP50637 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TspoP50637 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TspoP50637 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TspoP50637 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TspoP50637 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TspoP50637 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TspoP50637 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TspoP50637 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TspoP50637 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TspoP50637 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TspoP50637 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TspoP50637 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TspoP50637 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TspoP50637 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TspoP50637 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TspoP50637 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TspoP50637 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TspoP50637 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TspoP50637 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TspoP50637 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TspoP50637 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TspoP50637 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TspoP50637 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TspoP50637 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TspoP50637 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TspoP50637 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TspoP50637 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TspoP50637 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TspoP50637 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TspoP50637 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TspoP50637 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TspoP50637 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TspoP50637 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TspoP50637 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TspoP50637 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TspoP50637 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TspoP50637 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms