Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nkx2-1P50220 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nkx2-1P50220 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms