Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zic1P46684 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zic1P46684 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zic1P46684 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zic1P46684 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zic1P46684 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zic1P46684 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Zic1P46684 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Zic1P46684 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zic1P46684 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zic1P46684 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zic1P46684 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zic1P46684 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zic1P46684 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zic1P46684 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zic1P46684 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zic1P46684 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zic1P46684 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zic1P46684 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zic1P46684 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms