Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PpargP37238 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PpargP37238 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PpargP37238 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PpargP37238 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PpargP37238 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PpargP37238 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PpargP37238 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PpargP37238 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PpargP37238 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PpargP37238 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PpargP37238 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PpargP37238 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PpargP37238 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PpargP37238 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PpargP37238 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PpargP37238 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PpargP37238 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PpargP37238 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PpargP37238 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PpargP37238 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PpargP37238 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PpargP37238 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PpargP37238 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PpargP37238 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PpargP37238 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PpargP37238 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PpargP37238 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PpargP37238 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PpargP37238 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PpargP37238 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PpargP37238 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PpargP37238 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PpargP37238 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PpargP37238 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PpargP37238 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PpargP37238 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PpargP37238 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PpargP37238 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PpargP37238 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PpargP37238 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PpargP37238 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PpargP37238 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PpargP37238 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PpargP37238 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PpargP37238 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PpargP37238 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PpargP37238 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PpargP37238 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PpargP37238 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PpargP37238 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PpargP37238 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PpargP37238 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PpargP37238 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PpargP37238 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PpargP37238 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PpargP37238 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PpargP37238 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PpargP37238 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PpargP37238 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PpargP37238 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PpargP37238 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PpargP37238 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PpargP37238 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PpargP37238 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PpargP37238 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PpargP37238 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PpargP37238 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PpargP37238 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PpargP37238 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PpargP37238 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PpargP37238 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PpargP37238 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PpargP37238 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PpargP37238 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PpargP37238 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PpargP37238 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PpargP37238 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PpargP37238 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PpargP37238 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PpargP37238 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PpargP37238 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PpargP37238 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PpargP37238 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PpargP37238 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PpargP37238 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PpargP37238 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PpargP37238 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PpargP37238 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PpargP37238 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PpargP37238 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PpargP37238 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PpargP37238 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PpargP37238 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PpargP37238 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PpargP37238 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PpargP37238 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PpargP37238 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PpargP37238 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PpargP37238 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 335.4 ms