Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola2P33611 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola2P33611 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pola2P33611 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pola2P33611 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola2P33611 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola2P33611 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola2P33611 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola2P33611 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola2P33611 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pola2P33611 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pola2P33611 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pola2P33611 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pola2P33611 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms