Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mmp3P28862 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mmp3P28862 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Mmp3P28862 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms